SNP|位点检测统计及关联分析解密

• 检测单个的已知位置的SNP位点

如以rs序列号命名的SNP位点（如rs1042522），以及基因序列上某些跟一些性状相关的位点（如跟糖尿病相关的基因位点KLF11：c.920C>T）。

• 检测某段基因序列上的所有的突变位点

如基因的外显子测序查找突变位点。

• Sanger测序法

可用于检测以上两种类型的突变。针对于一代测序结果中突变分析统计不方便的情况，我们公司专门开发了相应的软件，可以使分析统计更方便更准确。

• Snapshot 法

可用于检测多个（>5个位点）的已知位置的SNP位点。

• Taqman探针法

可用于检测单个的已知位置的SNP位点。

• 哈迪-温伯格定律检验

检验待分析的位点在群体中是否符合哈迪-温伯格遗传平衡定律。 P值≥0.05表示位点在群体中符合哈迪-温伯格遗传。

• 目的位点与表型性状的关联分析

通过SPSS软件，对目的位点的基因型与要 分析的表型性状的关系进行显著性分析（LSD-t检验）。

• 不同检测位点之间的连锁不平衡分析

通过haploview软件对分析群体中检测位点之间的连锁不平衡关系进行分析，同时也可以找出单倍型Block。

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